Le vaccin anticoquelucheux et le vaccin antipoliomyélitique inactivé sont fabriqués à partir de bactéries ou de
virus vivants tués dans du formaldéhyde. Les toxines de la diphtérie et du tétanos sont inactivées à l'aide de
formaldéhyde afin de fabriquer les anatoxines. Après le processus d'inactivation, la purification des vaccins
permet de retirer presque la totalité du formaldéhyde. Le quintuble vaccin de la diphtérie, de la coqueluche,
du tétanos, de la polio et de l'Haemophilus b (Hib) contient moins de 0,02 % de formaldéhyde par dose, soit
moins de 200 parties par million. Cette quantité est plusieurs centaines de fois inférieure à celle qu'il faudrait
pour nuire à l'être humain.
Certains vaccins, comme les vaccins contre la diphtérie, le tétanos, la coqueluche et l'hépatite B, contiennent
un agent de préservation qui renferme du mercure, le thimérosal, et qui sert à éviter la contamination
bactérienne pendant la production du vaccin. Une dose de vaccin contient 0,01 % de thimérosal, soit
100 parties par million. Ce composé de mercure n'est pas toxique pour l'être humain et ne libère pas de
mercure dans l'organisme. Les vaccins conjugués au vaccin antipoliomyélitique inactivé (VAI), comme le
DCT + VAI, en usage au Canada, ne contiennent pas de thimérosal.
Plusieurs vaccins, comme les anatoxines tétanique et diphtérique et le vaccin contre l'hépatite B, renferment
un sel d'aluminium complexe, l'alun. La quantité d'aluminium contenue dans un vaccin équivaut à moins de
1 mg par dose. Selon les observations, cette quantité ne cause aucun tort à l'être humain. Certaines personnes
prennent et absorbent des quantités beaucoup plus élevées de sels d'aluminium sous forme d'antiacides (p.
ex., de 200 mg à 400 mg d'hydroxyde d'aluminium par comprimé), sans manifester d'effet secondaire
significatif.
Certains vaccins contiennent d'infimes traces des antibiotiques utilisés pendant le processus de fabrication.
Ces antibiotiques visent à prévenir la contamination bactérienne des cellules tissulaires sur lesquelles les virus
sont cultivés. Le vaccin contre la rougeole, la rubéole et les oreillons (vaccin RRO) et le vaccin
antipoliomyélitique inactivé (VAI) contiennent chacun moins de 25 microgrammes, ou moins de
0,000025 gramme, de néomycine par dose.