Après l'incendie qui a ravagé le premier Collège en 1899, le père Blanche a veillé au début de la reconstruction du deuxième Collège. Cependant, il n'est pas resté pour voir le projet mener à sa bonne fin. C'est Dagnaud qui le remplaça comme supérieur et c'est lui qui verra la fin de la construction du nouveau collège.

Le Collège construit après le feu de 1899	La chapelle qui se trouve au deuxième étage

Le nouveau Collège a accueilli ses premiers élèves en septembre 1899. Ce dernier immeuble s'élève à un étage plus haut que l'ancien. Cet édifice fait toujours partie de l'Université. De plus, une chapelle fut ajoutée à l'arrière de l'édifice.

En plus de surveiller la construction du Collège, père Dagnaud a également entrepris l'érection d'une nouvelle église à Pointe-de-l'Église. Cette dernière est l'Église Sainte-Marie actuelle. La construction a commencé en 1903 pour se terminer en 1905. Ce nouveau temple remplaçait l'ancienne église du père Sigogne.

Plus tard, en 1907, le bois de cette ancienne Église Sainte-Marie sera utilisé pour bâtir le couvent des soeurs des Saints-Coeurs de Jésus et Marie.