La discipline
Le père Blanche pensait que la discipline devait être d'une grande importance car à la fin de l'année scolaire 1899, il n'y avait pas de discipline chez les élèves et chez les pères. Il notait que les pères Conan et Haquin «ont eu une influence néfaste sur les jeunes.» C'est alors que la discipline pendant l'ère de Dagnaud sera bien plus renforcée.
Le corps professoral
Au Collège, le personnel comptait quatorze professeurs. Étant donné le nombre d'élèves toujours changeant, il existait souvent une disproportion entre eux et les professeurs.
La direction et le personnel du Collège Sainte-Anne s'embarquaient également sur la voie du développement parascolaire. Des cercles littéraires furent organisés et la musique ainsi que le théâtre prirent de l'importance.
En plus de travailler sur le plan physique du Collège Sainte-Anne,
Dagnaud a voulu élaborer un plan académique pour l'institution.
Il voulait améliorer «le déséquilibre du cours
classique» et les effets négatifs créés par
«la présence de l'Académie». Il aurait voulu
mieux équilibrer le cours classique mais cela ne se fit qu'en 1906-1907.
Les cours offerts demeuraient toujours les mêmes comme à l'époque
de Blanche sauf pour quelques petits changements. On a ajouté à
la programmation un cours en histoire littéraire et en 1904, la
chimie, la dissertation philosophique, mais le cours de dessin fut abandonné.