Rapport annuel de C-EnterNet 2008

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... Programme de surveillance nationale intégrée des agents pathogènes entériques

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Tables des matières

• Remerciements
• Sommaire
• 1. Introduction
• 2. Sommaire des cas humains
  • 2.1 Aperçu des cas humains
  • 2.2 Cas associés à une éclosion
  • 2.3 Cas liés à des voyages
  • 2.4 Cas endémiques
• 3. Campylobacter
  • 3.1 Cas humains
  • 3.2 Surveillance de l’exposition
  • 3.3 Distribution temporelle
  • 3.4 Sommaire des résultats relatifs à Campylobacter
• 4. Salmonella
  • 4.1 Cas humains
  • 4.2 Surveillance de l’exposition
  • 4.3 Distribution temporelle
  • 4.4 Sommaire des résultats relatifs à Salmonella
• 5. E. coli pathogène
  • 5.1 Cas humains
  • 5.2 Surveillance de l’exposition
  • 5.3 Distribution temporelle
  • 5.4 Sommaire des résultats relatifs à E. coli pathogène
• 6. Yersinia
  • 6.1 Cas humains
  • 6.2 Surveillance de l’exposition
  • 6.3 Sommaire des résultats relatifs à Yersinia
• 7. Listeria
  • 7.1 Cas humains
  • 7.2 Surveillance de l’exposition
  • 7.3 Sommaire des résultats relatifs à Listeria monocytogenes
• 8. Parasites
  • 8.1 Giardia
  • 8.2 Cryptosporidium
  • 8.3 Cyclosporose
  • 8.4 Amibiase
• 9. Variations temporelles
  • 9.1 Variations temporelles de l’incidence des maladies entériques
  • 9.2 Variations temporelles des sources d’exposition
• 10. Attribution de source
  • Information générée
  • ANNEXE A : Analyses de laboratoire
  • ANNEXE B : Réponses aux questionnaires
  • ANNEXE C : Changements méthodologiques en 2008
  • ANNEXE D : Résultats des dénombrements bactériens pour les échantillons de viande au détail

Liste des figures

• Figure 2.1 : Proportion relative des maladies entériques déclarées au site sentinelle 1 en 2008
• Figure 3.1 : Taux d’incidence des cas endémiques de campylobactériose au site sentinelle 1, en fonction de l’âge et du sexe, en 2008
• Figure 3.2 : Distribution temporelle des cas endémiques humains de campylobactériose au site sentinelle 1 en 2008
• Figure 3.3 : Distribution saisonnière de la contamination par toutes les sources de Campylobacter jejuni au site sentinelle 1 en 2008
• Figure 4.1 : Taux d’incidence des cas endémiques de salmonellose au site sentinelle 1, en fonction de l’âge et du sexe, en 2008
• Figure 4.2 : Distribution temporelle des cas endémiques humains de salmonellose au site sentinelle 1 en 2008
• Figure 4.3 : Distribution temporelle des salmonelles détectées chez les cas humains endémiques, dans l’eau de surface non traitée et dans les échantillons de viande au détail au site sentinelle 1 en 2008
• Figure 5.1 : Taux d’incidence des cas endémiques d’infection à par E.coli O157:H7 au site sentinelle 1, en fonction de l’âge et du sexe, en 2008
• Figure 6.1 : Taux d’incidence des cas endémiques de yersiniose au site sentinelle 1, en fonction de l’âge et du sexe, en 2008
• Figure 6.2 : Distribution temporelle des cas humains de yersiniose au site sentinelle 1 en 2008
• Figure 8.1 : Taux d’incidence des cas endémiques de giardiase au site sentinelle 1, en fonction de l’âge et du sexe, en 2008
• Figure 8.2 : Distribution mensuelle des cas de giardiase et de la détection de Giardia dans les échantillons d’eau de surface non traitée au site sentinelle 1 en 2008
• Figure 8.3 : Taux d’incidence des cas endémiques de cryptosporidiose au site sentinelle 1, en fonction de l’âge et du sexe, en 2008
• Figure 8.4 : Distribution mensuelle des cas de cryptosporidiose et de la détection de Cryptosporidium dans les échantillons d’eau de surface non traitée au le site sentinelle 1 en 2008
• Figure 8.5 : Taux d’incidence des cas endémiques d’amibiase au site sentinelle 1, en fonction de l’âge et du sexe, en 2008
• Figure 9.1 : Distribution mensuelle des dates du début de la maladie pour les cas endémiques de certaines maladies entériques déclarés au site sentinelle 1 en 2008
• Figure 9.2 : Distribution mensuelle (selon les dates du début de la maladie) des cas endémiques déclarés au site sentinelle 1 de juin 2005 à décembre 2008 pour certaines maladies entériques
• Figure 9.3 : Variations annuelles des agents pathogènes détectés dans les échantillons de fumier au site sentinelle 1, de 2006 à 2008
• Figure 9.4: Proportion (intervalle de confiance à 95 %) d’échantillons d’eau de surface non traitée dont les analyses par culture pour certains agents pathogènes entériques ont donné des résultats positifs au site sentinelle 1, de juin 2005 à décembre 2008
• Figure 9.5: Proportion (intervalle de confiance à 95 %) d’échantillons d’eau de surface non traitée dont les analyses par culture pour certains agents pathogènes entériques ont donné des résultats positifs au site sentinelle 1 de juin 2005 à décembre 2008 (hiver: décembre à février; printemps: mars à mai; été: juin à août; automne: septembre à novembre)
• Figure 9.6: Proportion (intervalle de confiance à 95 %) d’échantillons de viande au détail dont les analyses pour certains agents pathogènes ont donné des résultats positifs au site sentinelle 1, de juin 2005 à décembre 2008
• Figure 9.7: Proportion (intervalle de confiance à 95 %) d’échantillons de viande au détail dont les analyses pour certains agents pathogènes ont donné des résultats positifs au site sentinelle 1, de juin 2005 à décembre 2008 (hiver: décembre à février; printemps: mars à mai; été: juin à août; automne: septembre à novembre)

Liste des tableaux

• Tableau 2.1 : Nombre de cas de maladies entériques confirmées en laboratoire au site sentinelle 1 en 2008 et taux d’incidence pour 100 000 personnes-années
• Tableau 2.2 : Cas liés à un voyage au site sentinelle 1 en 2008
• Tableau 3.1 : Données de détection et de spéciation de Campylobacter (méthodes par culture) provenant des activités de surveillance intégrée menées au site sentinelle 1 en 2008
• Tableau 4.1 : Données de détection et de sérotypage de Salmonella (méthodes par culture) provenant des activités de surveillance intégrée menées au site sentinelle 1 en 2008
• Tableau 4.2 : Résultats de l’électrophorèse en champ pulsé (ECP) pour les sérotypes les plus courants de Salmonella pour tous les volets au site sentinelle 1 en 2008 (les valeurs indiquées entre parenthèses renvoient aux données cumulées de 2005 à 2007 à titre de comparaison)
• Tableau 5.1 : Données de détection d’E. coli producteur de vérocytotoxines provenant des activités de surveillance intégrée menées au site sentinelle 1 in 2008
• Tableau 5.2 : Profils d’électrophorèse en champ pulsé pour E. coli O157:H7 pour tous les volets au site sentinelle 1 en 2008 (les valeurs indiquées entre parenthèses renvoient aux données totalisées de 2006 et 2007 à titre de comparaison)
• Tableau 6.1 : Données de détection et de spéciation de Yersinia provenant des activités de surveillance intégrée menées au site sentinelle 1 en 2008
• Tableau 7.1 : Données de détection de Listeria monocytogenes provenant des activités de surveillance intégrée menées au site sentinelle 1 en 2008
• Tableau 7.2 : Données du sérotypage de Listeria monocytogenes provenant des activités de surveillance intégrée menées au site sentinelle 1 en 2008 (les valeurs indiquées entre parenthèses renvoient aux données de 2007, 2006 et 2005 à titre de comparaison)
• Tableau 7.3 : Profils d’ECP pour les isolats de Listeria monocytogenes provenant des activités de surveillance intégrée menées au site sentinelle 1 en 2008 (les valeurs indiquées entre parenthèses renvoient aux données de 2007, 2006 et 2005 à titre de comparaison)
• Tableau 8.1 : Données de détection et de sous-typage de Giardia provenant des activités de surveillance intégrée menées au site sentinelle 1 en 2008 (les valeurs indiquées entre parenthèses renvoient aux données de 2005 à 2007)
• Tableau 8.2 : Données de détection et de sous-typage de Cryptosporidium provenant des activités de surveillance intégrée menées au site sentinelle 1 en 2008 (les valeurs indiquées entre parenthèses renvoient aux données de 2005 à 2007)
• Tableau 9.1 : Résultats statistiques de l’analyse de régression de Poisson du dénombrement annuel, mensuel ou saisonnier des cas endémiques
• Tableau 9.2 : Résultats statistiques des analyses de régression logistique concernant l’effet des années ou des saisons sur la contamination des échantillons d’eau et de viande au détail par certains agents pathogènes au site sentinelle 1, de janvier 2006 à décembre 2008
• Tableau 10.1 : Plan et réalisations du programme C-EnterNet en matière d’attribution de source

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