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Analyse intégrée et rapport des résultats

Gestion et analyse des données

Le PICRA est conçu pour générer des renseignements sur la résistance aux antimicrobiens de la ferme à l’assiette, ainsi qu’à partir de cas cliniques humains et animaux. Au cours des dernières années, le PICRA, avec l’aide de la Direction de gestion de l’information/Direction de la technologie de l’information, a établi le Système de surveillance de la résistance aux antimicrobiens (SSRA) qui sert de base de données centralisée. Depuis la fin de 2006, des données certifiées provenant de trois laboratoires locaux de l’ASPC sont quotidiennement transmises dans une base de données centrale interactive où elles sont intégrées et normalisées. Les données sont ensuite triées, transformées et interprétées pour permettre la détermination du statut de la résistance aux antimicrobiens. Ces manipulations se font par le DEXA, un système d’extraction des données entretenu par le Programme de coordination des données du Bureau de la pratique en santé publique. Chaque rapport du PICRA a également été ajouté au système DEXA, ce qui permet de transmettre plus rapidement des données sur la résistance aux antimicrobiens à des utilisateurs finaux précis.

Les données sur la résistance aux antimicrobiens du PICRA sont interprétées à l’aide des valeurs seuils les plus récentes provenant du CLSI (Clinical Laboratory Standard Institute). Lorsqu’aucun critère d’interprétation du CLSI n’est disponible, le PICRA utilise les valeurs seuils épidémiologiques définies par la répartition des CMI. Afin de permettre des comparaisons internationales précises, toutes les valeurs seuils sont harmonisées avec celles du système NARMS (National Antimicrobial Resistance Monitoring System) des États‑Unis.

Tableau 1. Valeurs seuils pour Salmonella et E. coli en 2006 (plaque CMV1AGNF).
Antimicrobien1 Intervalle testé en 2006 μg/ml Valeurs seuils 2 μg/ml
S I R
Acide nalidixique 0,5-32 ≤ 16 – ≥ 32
Amikacine 0,5-32 ≤ 16 32 ≥ 64
Amoxicilline-acide clavulinique 1,0/0,5 – 32/16 ≤ 8/4 16/8 ≥ 32/16
Ampicilline 1-32 ≤ 8 16 ≥ 32
Céfoxitine 0,5-32 ≤ 8 16 ≥ 32
Ceftiofur 0,25-8 ≤ 2 4 ≥ 8
Ceftriaxone 0,25-64 ≤ 8 16-32 ≥ 64
Chloramphénicol 2-32 ≤ 8 16 ≥ 32
Ciprofloxacine 0,0156-4 ≤ 1 2 ≥ 4
Gentamicine 0,25-16 ≤ 4 8 ≥ 16
Kanamycine 8-64 ≤ 16 32 ≥ 64
Streptomycine3 32-64 ≤ 32 – ≥ 64
Sulfisoxazole 16-512 ≤ 256 – ≥ 512
Tétracycline 4-32 ≤ 4 8 ≥ 16
Triméthoprime-sulfaméthoxazole 0,12/2,38-4/76 ≤ 2/38 – ≥ 4/76

1Plaque CMV1AGNF
2Tableau 2A du CLSI M100-S16. Section sur les tests M7-A6-MIC.
3Aucun critère d’interprétation du CLSI disponible pour les entérobactéries et cet antimicrobien. Les valeurs seuils, basées sur la répartition des CMI, sont harmonisées avec celles du NARMS.
Tableau 2. Valeurs seuils pour les espèces Campylobacter en 2006 (plaque CAMPY).
Antimicrobien Intervalle testé en 2005 µg/ml Valeurs seuils1 µg/ml
S I R
Acide nalidixique 2 4-64 ≤ 16   ≥ 64
Azithromycine 2 0,015-64 ≤ 2   ≥ 8
Ciprofloxacine 0,015-64 ≤ 1 2  
Clindamycine 2 0,03-16 ≤ 2 4 ≥ 8
Érythromycine 0,03-64 ≤ 8 16 ≥ 32
Florfénicol 2 0,03-64 ≤ 4 S.O.3 S.O.
Gentamicine 2 0,12-32 ≤ 2 4 ≥ 8
Télithromycine 0,015-8 ≤ 4 8 ≥ 16
Tétracycline 0,06-64 ≤ 4 8 ≥ 16

1 CLSI M45
2 Aucun critère d’interprétation du CLSI pour Campylobacter et cet antimicrobien. Les valeurs seuils, basées sur la répartition des CMI, sont harmonisées avec celles du NARMS.
3 Aucune valeur seuil de résistance définie pour le moment.
Tableau 3. Valeurs seuils pour les espèces Enterococcus en 2006 (plaque CMV2AGPF).
Antimicrobien Intervalle testé en 2006 µg/ml Valeurs seuils1
µg/ml
S I R
Chloramphénicol 2-32 ≤ 8 16 ≥ 32
Ciprofloxacine 0,12-4 ≤ 1 2 ≥ 4
Daptomycine 2 (lipopeptide cyclique) 0,5-16 ≤ 4    
Érythromycine 0,5-8 ≤ 0,5 1-4 ≥ 8
Flavomycine 2 1-16 < 8 16 ≥ 32
Gentamicine (degré élevé) 128-1 024 < 500   ≥ 500
Kanamycine1 (degré élevé) 2 128-1 024 < 128   ≥ 256
Lincomycine 2 1-32 < 8 16 ≥ 32
Linézolide (oxazolidinones) 0,5-8 ≤ 2 4 ≥ 8
Nitrofurantoïne 2-64 ≤ 32 64 ≥ 128
Pénicilline 0,5-16 ≤ 8 – ≥ 16
Quinupristine-dalfopristine (streptogramines) 1-32 ≤ 1 2 ≥ 4
Streptomycine (degré élevé) 2 512-2 048 < 512   ≥ 1 000
Tétracycline 4-32 ≤ 4 8 ≥ 16
Tigécycline 0,015-0,5 ≤ 0,25 0,5 ≥ 1
Tylosine 2 0,25-32 < 4 16 ≥ 32
Vancomycine 0,5-32 ≤ 4 8-16 ≥ 32

1 Tableau 2D, CLSI M100-S16. Section des tests M7-A6-MIC.

2 Aucun critère d’interprétation du CLSI pour Enterococcus et cet antimicrobien. Les valeurs seuils, basées sur la répartition des CMI, sont harmonisées avec celles du NARMS.
Date de modification : 2007-11-05

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